Introducción a la bioinformática¶
El curso presente ser una introducción a los aspectos claves de la bioinformática, especialmente a los relacionados con el análisis de secuencias. Los temas principales son:
- búsqueda en bases de datos (ej. Entrez),
- alineamientos de secuencias
- alineamientos múltiples,
- secuenciación de Sanger,
- formatos de ficheros de secuencia,
- proyectos de secuenciación con Staden,
- predicción de la estructura génica,
- anotación,
- filogenia,
Las lecciones pretenden ser eminentemente prácticas, con una breve introducción teórica inicial. Sobre cada tema se propondrán varios ejercicios de complejidad creciente. Todo el software utilizado será libre y podrá descargarse gratuitamente en la web.
Profesores: Joaquín Cañizares Sales, Jose Blanca, Peio Ziarsolo
Temas¶
- Bases de datos biológicas
- Práctica bases de datos
- Alineamientos de secuencias
- Práctica jemboss
- Práctica de alineamientos
- Búsqueda de secuencias en bases de datos
- Práctica Blast
- Métodos predictivos en ADN y ARN
- Práctica predicción
- Alineamientos múltiples
- Práctica alineamiento múltiple
- Introducción al análisis de filogenias
- Práctica análisis de filogenias
- Práctica anotación con Blast2GO
- Prácticas bases de datos genómicas
- Ejercicio anotación
- Ejercicio prediccion 2
- Secuenciación de Sanger
- Ensamblaje de secuencias
- Práctica ensamblaje de secuencias