Introducción a la bioinformática¶
El curso presente ser una introducción a los aspectos claves de la bioinformática, especialmente a los relacionados con el análisis de secuencias. Los temas principales son:
búsqueda en bases de datos (ej. Entrez),
alineamientos de secuencias
alineamientos múltiples,
secuenciación de Sanger,
formatos de ficheros de secuencia,
proyectos de secuenciación con Staden,
predicción de la estructura génica,
anotación,
filogenia,
Las lecciones pretenden ser eminentemente prácticas, con una breve introducción teórica inicial. Sobre cada tema se propondrán varios ejercicios de complejidad creciente. Todo el software utilizado será libre y podrá descargarse gratuitamente en la web.
Profesores: Joaquín Cañizares Sales, Jose Blanca, Peio Ziarsolo
Temas¶
- Bases de datos biológicas
- Práctica bases de datos
- Alineamientos de secuencias
- Práctica jemboss
- Práctica de alineamientos
- Búsqueda de secuencias en bases de datos
- Práctica Blast
- Métodos predictivos en ADN y ARN
- Práctica predicción
- Alineamientos múltiples
- Práctica alineamiento múltiple
- Introducción al análisis de filogenias
- Práctica análisis de filogenias
- Práctica anotación con Blast2GO
- Prácticas bases de datos genómicas
- Ejercicio anotación
- Ejercicio prediccion 2
- Secuenciación de Sanger
- Ensamblaje de secuencias
- Práctica ensamblaje de secuencias